2011年に発売された日本の戦国時代が舞台の戦略ゲーム「TOTAL WAR：SHOGUN 2」──Creative Assembly社のリアルタイムストラテジー（ターン制でなくリアルタイムで戦況が変わる）ゲーム──の拡張パック「Fall of the Samurai」で幕末・戊辰戦争の要素がカバーされています。

維新志士や新撰組等のエージェントタイプが追加されて
プレイ可能のクラン（勢力）は、新政府側は薩摩藩・長州藩・土佐藩。
対する旧幕府軍が会津藩・長岡藩・請西藩です。

会津は定石として…ゲーム脳で考えたら佐幕側の長岡藩はガトリングガンでヒャッハーを容易に想像できるのですが、もう1枠が奥羽越列藩同盟の東北諸藩ではなく、なんと請西藩なのですよ！

Total War: Shogun 2 Fall of the Samurai – Limited Edition(PC用・輸入版)
※スタンドアロン（FalloftheSamurai単体）で起動可能

…というのを、今更知りました。推奨OSがwin7以下で日本語版は無いようです。
請西藩目当てでプレイするなら、jozai（拠点Kazusa）やYugekitaiの存在と林家の家紋の旗が動かせるだけで幸せになれる人向けで、洋ゲー慣れしてないと難しいかな？
Hayashi Tadataka（林忠崇）の顔グラは、ごついヒゲのおじさん。

ゲーム情報をざっと見た所、英語表記ですが各藩独自のユニット（兵士）として
長州潘は奇兵隊、白熊（はぐま。白い毛を被った指揮官）
薩摩潘は黒熊（こぐま）
土佐潘は赤熊（しゃぐま）、ライフル銃兵
会津潘は玄武隊・青龍隊・朱雀隊・白虎隊（白虎隊のグラがおじさんです。グラ変更MODもあるっぽい）
請西藩は遊撃隊
会津・長岡・請西藩で新撰組と彰義隊が使えるようです。

海戦では幕府艦隊の艦も登場するみたい。
SteamストアのDLC（拡張/ダウンロードコンテンツ。Total Warシリーズは日本からの購入制限有）新政府側に佐賀藩・津藩、佐幕側に仙台藩・小浜藩も追加されているようですね。

海外の請西でのキャンペーンプレイの評価を見ると、銃装で忍者と同じゲリラアビリティ持ちな遊撃隊の使い勝手が良いとの声。※洋ゲーなので幕末が舞台でも当然、忍者がいます

・TOTAL WAR公式サイト（英語）：http://www.totalwar.com/

【追記】起動にやや時間がかかりましたが（Amazon等でパッケージ版を購入した場合、初回起動時にSteamで最新データをDLします）プレイしてみました！ まずはシステムを覚えるためにカスタムバトル（ユニット名だけで固有名は出てきません）でちょこちょこ試してます。請西藩関連で何か面白いことがあれば改めてプレイ記を書きますね。

▼トータルウォー:ショーグン2日本語版
・SEGA公式サイト：http://totalwar.zoo.co.jp/

ショーグン2の戦国大名家は伊達・上杉・北条・武田・徳川・織田・毛利・長宗我部・島津。
源平時代のDLC（Rise of the Samurai）もあるようです。